现今，随着科学技术的发展，浮游生物计数仪的应用也越来越广泛。浮游生物计数仪的出现使得浮游生物的数量可以更好地得到控制。
　　池中浮游动物过多，威胁到池塘氧平衡时，可采取冲水压制或药物杀灭的办法，大量冲水对压制水蚤的数量很有效。杀灭枝角类的有效浓度0.03-0.05克/米3，杀灭桡足类0.1-0.5克/米3。池水中蓝藻过多时全池泼洒硫酸铜。硫酸铜的低有效浓度为0.7克/米3。但硫酸铜对鱼类的毒性也很大，因此不建议使用。而在不得不用时，应当在撒药处理后，立即大换水(池水的1/2-2/3)，以便将硫酸铜和杀死的蓝藻大部分排掉。罗非鱼很喜欢吃蓝藻，池塘混养罗非鱼是解决蓝藻的一个有力措施。
　　浮游生物在海洋中的垂直分布是普遍现象。分布在各个水层的浮游生物，无论是种类或是数量都不相同。通常在海洋上层数量多，下层数量少。在海洋中浮游生物大都分布在从海洋表面到100米深度的水层中，尤其是数米深以上的水层中为多。比起浮游植物，浮游动物由于食料、生殖、发育、海洋环流或上升流及气候改变等原因，都会引起垂直移动的现象，它们的垂直分布比浮游植物要深得多。在垂直运动中，浮游动物时而栖居于上层，时而迁居于中层，甚至大量集中于海域的下层。当然，这也与浮游动物具有主动运动的能力密不可分。
　　浮游植物硅藻等必须吸收太阳能进行光合作用，它们的垂直分布与海水的光照强度和透明度有关。在热带海洋和远洋，由于光照强以及透明度大，硅藻等分布较深；在寒带和温带海域，由于光照弱和透明度小，它们一般分布于靠近表层的水中。
一般来说，浮游生物的数量很难统计，但是有了浮游生物计数仪就不用担心了，可以很好地进行计数。